非负矩阵分解#

sklearn.decomposition.non_negative_factorization(X, W=None, H=None, n_components='auto', *, init=None, update_H=True, solver='cd', beta_loss='frobenius', tol=0.0001, max_iter=200, alpha_W=0.0, alpha_H='same', l1_ratio=0.0, random_state=None, verbose=0, shuffle=False)[source]#

计算非负矩阵分解 (NMF)。

寻找两个非负矩阵 (W, H),它们的乘积近似于非负矩阵 X。这种分解可以用于降维、源分离或主题提取等。

目标函数是

\[ \begin{align}\begin{aligned}L(W, H) &= 0.5 * ||X - WH||_{loss}^2\\ &+ alpha\_W * l1\_ratio * n\_features * ||vec(W)||_1\\ &+ alpha\_H * l1\_ratio * n\_samples * ||vec(H)||_1\\ &+ 0.5 * alpha\_W * (1 - l1\_ratio) * n\_features * ||W||_{Fro}^2\\ &+ 0.5 * alpha\_H * (1 - l1\_ratio) * n\_samples * ||H||_{Fro}^2,\end{aligned}\end{align} \]

其中 \(||A||_{Fro}^2 = \sum_{i,j} A_{ij}^2\)(Frobenius 范数)和 \(||vec(A)||_1 = \sum_{i,j} abs(A_{ij})\)(逐元素 L1 范数)

通用范数 \(||X - WH||_{loss}^2\) 可以表示 Frobenius 范数或其他支持的 beta 散度损失。选项之间的选择由 beta_loss 参数控制。

正则化项按 Wn_featuresHn_samples 进行缩放,以保持它们彼此之间以及与数据拟合项的影响尽可能平衡,并尽可能独立于训练集的大小 n_samples

目标函数通过交替最小化 W 和 H 来最小化。如果给定 H 且 update_H=False,则仅求解 W。

请注意,变换后的数据命名为 W,分量矩阵命名为 H。在 NMF 文献中,命名约定通常相反,因为数据矩阵 X 是转置的。

参数:
X形状为 (n_samples, n_features) 的 {array-like, sparse matrix}

常数矩阵。

W形状为 (n_samples, n_components) 的 array-like,默认为 None

如果 init='custom',则将其用作解的初始猜测。如果 update_H=False,则将其初始化为零数组,除非 solver='mu',则将其填充为 np.sqrt(X.mean() / self._n_components) 计算的值。如果为 None,则使用 init 中指定的初始化方法。

H形状为 (n_components, n_features) 的 array-like,默认为 None

如果 init='custom',则将其用作解的初始猜测。如果 update_H=False,则将其用作常数,仅求解 W。如果为 None,则使用 init 中指定的初始化方法。

n_componentsint 或 {'auto'} 或 None,默认为 'auto'

组件数量。如果为 None,则保留所有特征。如果 n_components='auto',则组件数量将根据 WH 的形状自动推断。

1.4 版更改: 添加了 'auto' 值。

1.6 版更改: 默认值从 None 更改为 'auto'

init{'random', 'nndsvd', 'nndsvda', 'nndsvdar', 'custom'},默认为 None

用于初始化过程的方法。

有效选项

  • None:如果 n_components < n_features,则为 'nndsvda',否则为 'random'。

  • ‘random’:非负随机矩阵,按以下比例缩放:sqrt(X.mean() / n_components)

  • ‘nndsvd’:非负双奇异值分解 (NNDSVD) 初始化(更适合稀疏性)

  • ‘nndsvda’:用 X 的平均值填充零的 NNDSVD(当不需要稀疏性时更好)

  • ‘nndsvdar’:用小随机值填充零的 NNDSVD(通常更快,当不需要稀疏性时,它是 NNDSVDa 的不太精确的替代方案)

  • ‘custom’:如果 update_H=True,则使用必须同时提供的自定义矩阵 W 和 H。如果 update_H=False,则仅使用自定义矩阵 H。

0.23 版更改: init 的默认值在 0.23 版中从 'random' 更改为 None。

1.1版本变更: init=None且n_components小于n_samples和n_features时,默认使用nndsvda而不是nndsvd

update_H布尔值,默认为True

设置为True,则W和H都将根据初始猜测进行估计。设置为False,则只估计W。

solver{'cd', 'mu'},默认为'cd'

使用的数值求解器

  • ‘cd’ 是一个使用快速分层交替最小二乘法 (Fast HALS) 的坐标下降求解器。

  • ‘mu’ 是一个乘法更新求解器。

0.17版本新增: 坐标下降求解器。

0.19版本新增: 乘法更新求解器。

beta_loss浮点数或{'frobenius', 'kullback-leibler', 'itakura-saito'},默认为'frobenius'

要最小化的β散度,用于测量X和点积WH之间的距离。请注意,与'frobenius'(或2)和'kullback-leibler'(或1)不同的值会导致拟合速度明显变慢。请注意,对于beta_loss <= 0(或'itakura-saito'),输入矩阵X不能包含零。仅在'mu'求解器中使用。

0.19版本新增。

tol浮点数,默认为1e-4

停止条件的容差。

max_iter整数,默认为200

超时之前的最大迭代次数。

alpha_W浮点数,默认为0.0

乘以W正则化项的常数。将其设置为零(默认值)表示对W没有正则化。

1.0版本新增。

alpha_H浮点数或“same”,默认为“same”

乘以H正则化项的常数。将其设置为零表示对H没有正则化。如果为“same”(默认值),则取与alpha_W相同的值。

1.0版本新增。

l1_ratio浮点数,默认为0.0

正则化混合参数,其中0 <= l1_ratio <= 1。对于l1_ratio = 0,惩罚是逐元素的L2惩罚(又名Frobenius范数)。对于l1_ratio = 1,它是逐元素的L1惩罚。对于0 < l1_ratio < 1,惩罚是L1和L2的组合。

random_state整数、RandomState实例或None,默认为None

用于NMF初始化(当init == 'nndsvdar'或'random'时),以及在坐标下降中。传递一个整数以在多次函数调用中获得可重复的结果。参见术语表

verbose整数,默认为0

详细程度。

shuffle布尔值,默认为False

如果为真,则在CD求解器中随机化坐标的顺序。

返回:
W形状为(n_samples, n_components)的ndarray

非负最小二乘问题的解。

H形状为(n_components, n_features)的ndarray

非负最小二乘问题的解。

n_iter整数

实际迭代次数。

参考文献

[1]

“用于大规模非负矩阵和张量分解的快速局部算法” Cichocki, Andrzej, and P. H. A. N. Anh-Huy. IEICE transactions on fundamentals of electronics, communications and computer sciences 92.3: 708-721, 2009。

[2]

“使用β散度的非负矩阵分解算法” Fevotte, C., & Idier, J. (2011). Neural Computation, 23(9)。

示例

>>> import numpy as np
>>> X = np.array([[1,1], [2, 1], [3, 1.2], [4, 1], [5, 0.8], [6, 1]])
>>> from sklearn.decomposition import non_negative_factorization
>>> W, H, n_iter = non_negative_factorization(
...     X, n_components=2, init='random', random_state=0)