用于图像分割的谱聚类#

在本例中,将生成具有连接圆的图像,并使用谱聚类来分离圆。

在这些设置中,谱聚类方法解决了被称为“归一化图割”的问题:图像被视为连接体素的图,谱聚类算法相当于选择定义区域的图割,同时最小化沿割的梯度与区域体积的比率。

由于算法试图平衡体积(即平衡区域大小),如果我们采用不同大小的圆,则分割会失败。

此外,由于图像的强度或其梯度中没有有用信息,我们选择在仅由梯度弱通知的图上执行谱聚类。这接近于对图执行 Voronoi 分区。

此外,我们使用对象的掩码将图限制为对象的轮廓。在本例中,我们感兴趣的是将对象彼此分离,而不是与背景分离。

# Authors:  Emmanuelle Gouillart <[email protected]>
#           Gael Varoquaux <[email protected]>
# License: BSD 3 clause

生成数据#

import numpy as np

l = 100
x, y = np.indices((l, l))

center1 = (28, 24)
center2 = (40, 50)
center3 = (67, 58)
center4 = (24, 70)

radius1, radius2, radius3, radius4 = 16, 14, 15, 14

circle1 = (x - center1[0]) ** 2 + (y - center1[1]) ** 2 < radius1**2
circle2 = (x - center2[0]) ** 2 + (y - center2[1]) ** 2 < radius2**2
circle3 = (x - center3[0]) ** 2 + (y - center3[1]) ** 2 < radius3**2
circle4 = (x - center4[0]) ** 2 + (y - center4[1]) ** 2 < radius4**2

绘制四个圆#

img = circle1 + circle2 + circle3 + circle4

# We use a mask that limits to the foreground: the problem that we are
# interested in here is not separating the objects from the background,
# but separating them one from the other.
mask = img.astype(bool)

img = img.astype(float)
img += 1 + 0.2 * np.random.randn(*img.shape)

将图像转换为边缘上具有梯度值的图。

from sklearn.feature_extraction import image

graph = image.img_to_graph(img, mask=mask)

取梯度的递减函数,得到接近 Voronoi 分区的分割

graph.data = np.exp(-graph.data / graph.data.std())

这里我们使用 arpack 求解器执行谱聚类,因为 amg 在此示例中数值不稳定。然后我们绘制结果。

import matplotlib.pyplot as plt

from sklearn.cluster import spectral_clustering

labels = spectral_clustering(graph, n_clusters=4, eigen_solver="arpack")
label_im = np.full(mask.shape, -1.0)
label_im[mask] = labels

fig, axs = plt.subplots(nrows=1, ncols=2, figsize=(10, 5))
axs[0].matshow(img)
axs[1].matshow(label_im)

plt.show()
plot segmentation toy

绘制两个圆#

这里我们重复上述过程,但只考虑我们生成的前两个圆。请注意,这会导致圆之间的分离更清晰,因为在这种情况下区域大小更容易平衡。

img = circle1 + circle2
mask = img.astype(bool)
img = img.astype(float)

img += 1 + 0.2 * np.random.randn(*img.shape)

graph = image.img_to_graph(img, mask=mask)
graph.data = np.exp(-graph.data / graph.data.std())

labels = spectral_clustering(graph, n_clusters=2, eigen_solver="arpack")
label_im = np.full(mask.shape, -1.0)
label_im[mask] = labels

fig, axs = plt.subplots(nrows=1, ncols=2, figsize=(10, 5))
axs[0].matshow(img)
axs[1].matshow(label_im)

plt.show()
plot segmentation toy

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