使用树集成进行特征转换#

将您的特征转换为更高维度的稀疏空间。然后在此特征上训练线性模型。

首先在训练集上拟合一个树集成(完全随机树、随机森林或梯度提升树)。然后,集成中每棵树的每个叶节点在新特征空间中分配一个固定的任意特征索引。然后以独热编码的方式对这些叶节点索引进行编码。

每个样本都会经过集成中每棵树的决策,最终落在每棵树的一个叶节点上。通过将这些叶节点的特征值设置为 1,其他特征值设置为 0 来对样本进行编码。

然后,生成的转换器学习了数据的监督、稀疏、高维类别嵌入。

# Authors: The scikit-learn developers
# SPDX-License-Identifier: BSD-3-Clause

首先,我们将创建一个大型数据集并将其分成三个集合

  • 一个集合用于训练稍后用作特征工程转换器的集成方法;

  • 一个集合用于训练线性模型;

  • 一个集合用于测试线性模型。

以这种方式分割数据很重要,可以避免通过数据泄露导致过拟合。

from sklearn.datasets import make_classification
from sklearn.model_selection import train_test_split

X, y = make_classification(n_samples=80_000, random_state=10)

X_full_train, X_test, y_full_train, y_test = train_test_split(
    X, y, test_size=0.5, random_state=10
)
X_train_ensemble, X_train_linear, y_train_ensemble, y_train_linear = train_test_split(
    X_full_train, y_full_train, test_size=0.5, random_state=10
)

对于每种集成方法,我们将使用 10 个估计器和最大 3 层深度。

n_estimators = 10
max_depth = 3

首先,我们将从在分离的训练集上训练随机森林和梯度提升开始

from sklearn.ensemble import GradientBoostingClassifier, RandomForestClassifier

random_forest = RandomForestClassifier(
    n_estimators=n_estimators, max_depth=max_depth, random_state=10
)
random_forest.fit(X_train_ensemble, y_train_ensemble)

gradient_boosting = GradientBoostingClassifier(
    n_estimators=n_estimators, max_depth=max_depth, random_state=10
)
_ = gradient_boosting.fit(X_train_ensemble, y_train_ensemble)

请注意,HistGradientBoostingClassifierGradientBoostingClassifier 快得多,从中等数据集开始 (n_samples >= 10_000),在本例中并非如此。

RandomTreesEmbedding 是一种无监督方法,因此不需要独立训练。

from sklearn.ensemble import RandomTreesEmbedding

random_tree_embedding = RandomTreesEmbedding(
    n_estimators=n_estimators, max_depth=max_depth, random_state=0
)

现在,我们将创建三个管道,这些管道将上述嵌入用作预处理阶段。

随机树嵌入可以直接与逻辑回归进行管道化,因为它是一个标准的 scikit-learn 变换器。

from sklearn.linear_model import LogisticRegression
from sklearn.pipeline import make_pipeline

rt_model = make_pipeline(random_tree_embedding, LogisticRegression(max_iter=1000))
rt_model.fit(X_train_linear, y_train_linear)
Pipeline(steps=[('randomtreesembedding',
                 RandomTreesEmbedding(max_depth=3, n_estimators=10,
                                      random_state=0)),
                ('logisticregression', LogisticRegression(max_iter=1000))])
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然后,我们可以将随机森林或梯度提升与逻辑回归进行管道化。但是,特征转换将通过调用 apply 方法来完成。scikit-learn 中的管道期望调用 transform。因此,我们将对 apply 的调用包装在 FunctionTransformer 中。

from sklearn.preprocessing import FunctionTransformer, OneHotEncoder


def rf_apply(X, model):
    return model.apply(X)


rf_leaves_yielder = FunctionTransformer(rf_apply, kw_args={"model": random_forest})

rf_model = make_pipeline(
    rf_leaves_yielder,
    OneHotEncoder(handle_unknown="ignore"),
    LogisticRegression(max_iter=1000),
)
rf_model.fit(X_train_linear, y_train_linear)
Pipeline(steps=[('functiontransformer',
                 FunctionTransformer(func=<function rf_apply at 0x74b4aa9389d0>,
                                     kw_args={'model': RandomForestClassifier(max_depth=3,
                                                                              n_estimators=10,
                                                                              random_state=10)})),
                ('onehotencoder', OneHotEncoder(handle_unknown='ignore')),
                ('logisticregression', LogisticRegression(max_iter=1000))])
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def gbdt_apply(X, model):
    return model.apply(X)[:, :, 0]


gbdt_leaves_yielder = FunctionTransformer(
    gbdt_apply, kw_args={"model": gradient_boosting}
)

gbdt_model = make_pipeline(
    gbdt_leaves_yielder,
    OneHotEncoder(handle_unknown="ignore"),
    LogisticRegression(max_iter=1000),
)
gbdt_model.fit(X_train_linear, y_train_linear)
Pipeline(steps=[('functiontransformer',
                 FunctionTransformer(func=<function gbdt_apply at 0x74b4aadea550>,
                                     kw_args={'model': GradientBoostingClassifier(n_estimators=10,
                                                                                  random_state=10)})),
                ('onehotencoder', OneHotEncoder(handle_unknown='ignore')),
                ('logisticregression', LogisticRegression(max_iter=1000))])
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最后,我们可以显示所有模型的不同 ROC 曲线。

import matplotlib.pyplot as plt

from sklearn.metrics import RocCurveDisplay

_, ax = plt.subplots()

models = [
    ("RT embedding -> LR", rt_model),
    ("RF", random_forest),
    ("RF embedding -> LR", rf_model),
    ("GBDT", gradient_boosting),
    ("GBDT embedding -> LR", gbdt_model),
]

model_displays = {}
for name, pipeline in models:
    model_displays[name] = RocCurveDisplay.from_estimator(
        pipeline, X_test, y_test, ax=ax, name=name
    )
_ = ax.set_title("ROC curve")
ROC curve
_, ax = plt.subplots()
for name, pipeline in models:
    model_displays[name].plot(ax=ax)

ax.set_xlim(0, 0.2)
ax.set_ylim(0.8, 1)
_ = ax.set_title("ROC curve (zoomed in at top left)")
ROC curve (zoomed in at top left)

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