scikit-learn 0.22 的发布亮点#

我们很高兴地宣布 scikit-learn 0.22 的发布,其中包含许多错误修复和新功能!我们将在下面详细介绍此版本的一些主要功能。有关所有更改的详尽列表,请参阅发布说明.

要安装最新版本(使用 pip)

pip install --upgrade scikit-learn

或使用 conda

conda install -c conda-forge scikit-learn

新的绘图 API#

现在提供了一个新的绘图 API 用于创建可视化。这个新的 API 允许快速调整绘图的视觉效果,而无需进行任何重新计算。也可以将不同的绘图添加到同一个图形中。以下示例说明了 plot_roc_curve,但也支持其他绘图工具,例如 plot_partial_dependenceplot_precision_recall_curveplot_confusion_matrix。有关此新 API 的更多信息,请参阅 用户指南

import matplotlib.pyplot as plt

from sklearn.datasets import make_classification
from sklearn.ensemble import RandomForestClassifier

# from sklearn.metrics import plot_roc_curve
from sklearn.metrics import RocCurveDisplay
from sklearn.model_selection import train_test_split
from sklearn.svm import SVC

X, y = make_classification(random_state=0)
X_train, X_test, y_train, y_test = train_test_split(X, y, random_state=42)

svc = SVC(random_state=42)
svc.fit(X_train, y_train)
rfc = RandomForestClassifier(random_state=42)
rfc.fit(X_train, y_train)

# plot_roc_curve has been removed in version 1.2. From 1.2, use RocCurveDisplay instead.
# svc_disp = plot_roc_curve(svc, X_test, y_test)
# rfc_disp = plot_roc_curve(rfc, X_test, y_test, ax=svc_disp.ax_)
svc_disp = RocCurveDisplay.from_estimator(svc, X_test, y_test)
rfc_disp = RocCurveDisplay.from_estimator(rfc, X_test, y_test, ax=svc_disp.ax_)
rfc_disp.figure_.suptitle("ROC curve comparison")

plt.show()
ROC curve comparison

堆叠分类器和回归器#

StackingClassifierStackingRegressor 允许您拥有一个包含最终分类器或回归器的估计器堆栈。堆叠泛化包括堆叠单个估计器的输出,并使用分类器来计算最终预测。堆叠允许通过使用每个单个估计器的输出作为最终估计器的输入来利用每个单个估计器的优势。基本估计器在完整的 X 上进行拟合,而最终估计器则使用 cross_val_predict 使用基本估计器的交叉验证预测进行训练。

用户指南 中了解更多信息。

from sklearn.datasets import load_iris
from sklearn.ensemble import StackingClassifier
from sklearn.linear_model import LogisticRegression
from sklearn.model_selection import train_test_split
from sklearn.pipeline import make_pipeline
from sklearn.preprocessing import StandardScaler
from sklearn.svm import LinearSVC

X, y = load_iris(return_X_y=True)
estimators = [
    ("rf", RandomForestClassifier(n_estimators=10, random_state=42)),
    ("svr", make_pipeline(StandardScaler(), LinearSVC(dual="auto", random_state=42))),
]
clf = StackingClassifier(estimators=estimators, final_estimator=LogisticRegression())
X_train, X_test, y_train, y_test = train_test_split(X, y, stratify=y, random_state=42)
clf.fit(X_train, y_train).score(X_test, y_test)
0.9473684210526315

基于排列的特征重要性#

inspection.permutation_importance 可用于获取对任何拟合估计器的每个特征重要性的估计。

import matplotlib.pyplot as plt
import numpy as np

from sklearn.datasets import make_classification
from sklearn.ensemble import RandomForestClassifier
from sklearn.inspection import permutation_importance

X, y = make_classification(random_state=0, n_features=5, n_informative=3)
feature_names = np.array([f"x_{i}" for i in range(X.shape[1])])

rf = RandomForestClassifier(random_state=0).fit(X, y)
result = permutation_importance(rf, X, y, n_repeats=10, random_state=0, n_jobs=2)

fig, ax = plt.subplots()
sorted_idx = result.importances_mean.argsort()
ax.boxplot(
    result.importances[sorted_idx].T, vert=False, labels=feature_names[sorted_idx]
)
ax.set_title("Permutation Importance of each feature")
ax.set_ylabel("Features")
fig.tight_layout()
plt.show()
Permutation Importance of each feature

对梯度提升的缺失值提供原生支持#

ensemble.HistGradientBoostingClassifierensemble.HistGradientBoostingRegressor 现在对缺失值(NaN)提供原生支持。这意味着在训练或预测时无需对数据进行插补。

from sklearn.ensemble import HistGradientBoostingClassifier

X = np.array([0, 1, 2, np.nan]).reshape(-1, 1)
y = [0, 0, 1, 1]

gbdt = HistGradientBoostingClassifier(min_samples_leaf=1).fit(X, y)
print(gbdt.predict(X))
[0 0 1 1]

预先计算的稀疏最近邻图#

大多数基于最近邻图的估计器现在接受预先计算的稀疏图作为输入,以便在多个估计器拟合中重复使用同一个图。要在管道中使用此功能,可以使用 memory 参数,以及两个新的转换器之一,neighbors.KNeighborsTransformerneighbors.RadiusNeighborsTransformer。预先计算也可以由自定义估计器执行,以使用替代实现,例如近似最近邻方法。在 用户指南 中查看更多详细信息。

from tempfile import TemporaryDirectory

from sklearn.manifold import Isomap
from sklearn.neighbors import KNeighborsTransformer
from sklearn.pipeline import make_pipeline

X, y = make_classification(random_state=0)

with TemporaryDirectory(prefix="sklearn_cache_") as tmpdir:
    estimator = make_pipeline(
        KNeighborsTransformer(n_neighbors=10, mode="distance"),
        Isomap(n_neighbors=10, metric="precomputed"),
        memory=tmpdir,
    )
    estimator.fit(X)

    # We can decrease the number of neighbors and the graph will not be
    # recomputed.
    estimator.set_params(isomap__n_neighbors=5)
    estimator.fit(X)

基于 KNN 的插补#

我们现在支持使用 k 近邻来完成缺失值的插补。

每个样本的缺失值都使用训练集中找到的 n_neighbors 个最近邻的平均值进行插补。如果两个样本都没有缺失的特征彼此接近,则这两个样本彼此接近。默认情况下,使用支持缺失值的欧几里得距离度量,nan_euclidean_distances,来查找最近邻。

用户指南 中了解更多信息。

from sklearn.impute import KNNImputer

X = [[1, 2, np.nan], [3, 4, 3], [np.nan, 6, 5], [8, 8, 7]]
imputer = KNNImputer(n_neighbors=2)
print(imputer.fit_transform(X))
[[1.  2.  4. ]
 [3.  4.  3. ]
 [5.5 6.  5. ]
 [8.  8.  7. ]]

树剪枝#

现在可以在构建树后对大多数基于树的估计器进行剪枝。剪枝基于最小成本复杂度。在 用户指南 中查看有关详细信息。

X, y = make_classification(random_state=0)

rf = RandomForestClassifier(random_state=0, ccp_alpha=0).fit(X, y)
print(
    "Average number of nodes without pruning {:.1f}".format(
        np.mean([e.tree_.node_count for e in rf.estimators_])
    )
)

rf = RandomForestClassifier(random_state=0, ccp_alpha=0.05).fit(X, y)
print(
    "Average number of nodes with pruning {:.1f}".format(
        np.mean([e.tree_.node_count for e in rf.estimators_])
    )
)
Average number of nodes without pruning 22.3
Average number of nodes with pruning 6.4

从 OpenML 检索数据帧#

datasets.fetch_openml 现在可以返回 pandas 数据帧,从而正确处理具有异构数据的 数据集。

from sklearn.datasets import fetch_openml

titanic = fetch_openml("titanic", version=1, as_frame=True, parser="pandas")
print(titanic.data.head()[["pclass", "embarked"]])
   pclass embarked
0       1        S
1       1        S
2       1        S
3       1        S
4       1        S

检查估计器的 scikit-learn 兼容性#

开发人员可以使用 check_estimator 检查其 scikit-learn 兼容估计器的兼容性。例如,check_estimator(LinearSVC()) 通过。

我们现在提供了一个 pytest 特定装饰器,它允许 pytest 独立运行所有检查并报告失败的检查。

..note:

此条目在 0.24 版本中略有更新,其中不再支持传递类:改为传递实例。

from sklearn.linear_model import LogisticRegression
from sklearn.tree import DecisionTreeRegressor
from sklearn.utils.estimator_checks import parametrize_with_checks


@parametrize_with_checks([LogisticRegression(), DecisionTreeRegressor()])
def test_sklearn_compatible_estimator(estimator, check):
    check(estimator)

ROC AUC 现在支持多类分类#

roc_auc_score 函数也可以用于多类分类。目前支持两种平均策略:一对一算法计算成对 ROC AUC 分数的平均值,而一对其余算法计算每个类别相对于所有其他类别的 ROC AUC 分数的平均值。在这两种情况下,多类 ROC AUC 分数都是根据模型计算出的样本属于特定类别的概率估计值来计算的。OvO 和 OvR 算法支持统一加权(average='macro')和按流行度加权(average='weighted')。

用户指南 中了解更多信息。

from sklearn.datasets import make_classification
from sklearn.metrics import roc_auc_score
from sklearn.svm import SVC

X, y = make_classification(n_classes=4, n_informative=16)
clf = SVC(decision_function_shape="ovo", probability=True).fit(X, y)
print(roc_auc_score(y, clf.predict_proba(X), multi_class="ovo"))
0.9950908119658122

脚本的总运行时间:(0 分钟 1.434 秒)

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